Movable Type に XSS の脆弱性が発見されたそうで、ちょっとおっくうに感じつつもアップグレード。

ここ とか見ると、かなり面倒そうなんだけども、 rsync が使える環境なら一瞬で終ります。

 % rsync -auv MT-3.33-ja/ remoteuser@remotehost:/path/to/mt/

リモートのバックアップをとっておくのを忘れずに。
また、今回のようなセキュリティFixの場合に限定したほうが良いでしょう。
公式の方法ではないので、この方法を使う場合は自己責任で〜。